Eine Bronchoskopie erfolgt, wenn bestimmte Erkrankungen der Bronchien und der Luftröhre untersucht werden sollen. Sinnvoll kann die Untersuchung beispielsweise sein, um die Ursache eines chronischen Hustens festzustellen oder um eine genauere Beurteilung von Auffälligkeiten in einer Röntgenaufnahme zu ermöglichen.
So ist die Bronchienspiegelung oft wichtig bei einem Tumorverdacht, z. B. Bronchialkarzinom (Lungenkrebs), sowie beim Verdacht auf infektiöse Erkrankungen wie Lungenentzündung (Pneumonie), Abszess (abgekapselte Entzündung) oder Infiltrate (eingewanderte Krankheitskeime). Außerdem wird eine Bronchoskopie oft bei einem Fremdkörper in den Bronchien durchgeführt, damit dieser herausgeholt werden kann.